Logiciels de facturation : comparatif pour choisir (et e-invoicing)
Choisir un logiciel de facturation n'a jamais été aussi délicat : la réforme de la facturation électronique, qui s'impose progressivement à toutes les entreprises françaises à partir de septembre 2026, ajoute un critère incontournable au comparatif habituel (prix, ergonomie, fonctions). Avant de trancher, voici ce que vous devez savoir pour ne pas vous retrouver avec un outil obsolète dans six mois.
Ce qui change en 2026-2027
À partir du 1er septembre 2026, toute entreprise assujettie à la TVA devra être en capacité de recevoir des factures électroniques via une plateforme agréée (PA). Les grandes entreprises et ETI devront aussi émettre en électronique dès cette date. Les TPE, PME et micro-entrepreneurs ont jusqu'au 1er septembre 2027 pour l'émission. Le Portail Public de Facturation (PPF) ne jouera qu'un rôle d'annuaire ; toutes les factures transiteront par des PA immatriculées par la DGFiP.
Le critère n°1 en 2026 : la conformité e-invoicing
Avant de comparer prix et ergonomie, vérifiez une seule chose : le logiciel est-il une Plateforme Agréée (PA) immatriculée par la DGFiP ? Sans cette accréditation, votre outil devra obligatoirement se connecter à une PA tierce pour transmettre vos factures, ce qui complique la chaîne et peut générer des coûts supplémentaires.
Parmi les solutions grand public, Pennylane, Indy, Tiime et Abby figurent sur la liste officielle des PA agréées. C'est un filtre décisif : si votre logiciel actuel n'est pas dans cette liste, planifiez dès maintenant la migration.
Comparatif des principaux logiciels de facturation
| Logiciel | Cible principale | Points forts | Prix indicatif |
|---|---|---|---|
| Tiime | Auto-entrepreneurs, freelances, TPE | Gratuit et illimité en facturation, PA agréée DGFiP, compte pro intégré, interface épurée | Gratuit ; payant à partir de 14,90 €/mois (compta) |
| Indy | Indépendants, professions libérales (BNC) | PA agréée, compta automatisée, import bancaire, déclarations TVA/IR/IS | Gratuit (facturation) ; Premium à 15 €/mois |
| Abby | Micro-entrepreneurs, petites structures | PA agréée, devis + factures + livres obligatoires en gratuit, prise en main rapide | Gratuit ; Pro à partir de 12 €/mois |
| Pennylane | PME B2B, TPE avec expert-comptable | PA agréée, full-stack compta + facturation, plus de 100 intégrations, collaboratif expert-comptable | À partir de 14 €/mois (indépendants) ; à partir de 49 €/mois (PME) |
| Sellsy | PME avec cycle de vente actif | CRM + facturation + trésorerie unifiés, pipeline commercial, relances automatiques | Sur devis (à partir de ~39 €/utilisateur/mois) |
| QuickBooks France | Très petites structures, artisans | Interface simple, gestion des dépenses, connexion bancaire, notoriété internationale | À partir de ~12 €/mois |
| Henrri | Auto-entrepreneurs, indépendants | Gratuit et illimité, prise en main immédiate, aucun engagement | Gratuit (statut PA à confirmer) |
Tarifs HT, relevés en juin 2026. Consultez les sites officiels pour les prix à jour.
Tiime : la référence gratuite et conforme
Tiime est la solution qui revient le plus souvent dans les comparatifs auto-entrepreneurs en 2026, et pour une bonne raison : facturation illimitée, devis, acomptes, relances automatiques et factures récurrentes sont tous inclus dans la version gratuite. L'outil est PA agréée, ce qui signifie qu'il sera nativement compatible avec l'obligation d'émission électronique de 2027 sans rien changer de votre côté.
Pour les indépendants qui souhaitent aller plus loin (déclarations TVA, synchronisation bancaire complète, comptabilité), la formule payante prend le relais à partir de 14,90 €/mois.
Indy : taillé pour les professions libérales
Indy s'est construit sur les besoins des BNC : sage-femme, consultant, traducteur, développeur freelance. Son moteur de catégorisation automatique des transactions bancaires est particulièrement affiné pour ce public. La version gratuite couvre la facturation de base ; la version Premium à 15 €/mois ajoute la comptabilité complète, l'OCR des justificatifs et les déclarations fiscales.
Indy est PA agréée DGFiP, donc conforme pour la réforme e-invoicing.
Abby : la simplicité pour les micro-entrepreneurs
Abby mise sur l'ergonomie avant tout. En version gratuite, on peut éditer devis, factures et les deux livres obligatoires pour les micro-entreprises (livre des recettes, registre des achats). C'est suffisant pour démarrer sans débourser un euro. La version Pro à 12 €/mois débloque les relances, les statistiques et l'archivage légal.
Abby fait partie des quelques PA gratuites agréées par la DGFiP, un atout non négligeable pour préparer la transition.
Pennylane : le choix des PME qui veulent tout centraliser
Pennylane vise un marché différent : les PME B2B qui veulent fusionner facturation, comptabilité et gestion de trésorerie dans un seul outil, souvent en lien direct avec leur expert-comptable. Plus de 100 intégrations natives (Sage, Cegid, Stripe...) et une interface collaborative font de Pennylane la référence côté PME en France.
Les tarifs démarrent à 14 €/mois pour un indépendant et montent à 49-298 €/mois pour les formules entreprise avec module comptable complet. Pennylane est PA agréée.
Sellsy : pour les PME avec un cycle de vente structuré
Si votre activité repose sur un pipeline commercial (prospection, devis, bon de commande, facture, relance), Sellsy est la seule solution de cette liste à proposer CRM + facturation + trésorerie dans un environnement unifié. Le prix, sur devis, reflète la richesse fonctionnelle. À réserver aux structures qui ont réellement besoin de la dimension CRM, les autres s'en passeront sans regret.
QuickBooks et Henrri : les alternatives à connaître
QuickBooks, édité par Intuit, est bien implanté chez les artisans et très petites structures grâce à sa gestion des dépenses et sa connexion bancaire. Son statut PA n'est pas garanti à date de parution de cet article : à vérifier sur le registre DGFiP avant de souscrire.
Henrri reste une option gratuite sans engagement à surveiller : l'outil est simple et apprécié, mais la confirmation de son accréditation PA est à valider directement auprès de l'éditeur ou sur le registre officiel.
Gratuit ou payant : comment décider ?
La question ne se réduit pas au budget. Voici les situations qui justifient de passer à une offre payante :
- Vous êtes assujetti à la TVA et devez produire des déclarations régulières (CA3, CA12).
- Vous avez besoin d'un rapprochement bancaire automatique pour gagner du temps.
- Votre expert-comptable travaille sur les mêmes données en temps réel.
- Vous gérez plusieurs collaborateurs ou avez des droits d'accès à paramétrer.
- Vous devez produire une liasse fiscale ou un bilan formel.
Pour un micro-entrepreneur en dessous des seuils TVA, Tiime, Indy ou Abby en gratuit couvrent l'essentiel sans friction.
À retenir avant de choisir
Vérifiez systématiquement trois points : (1) le logiciel est-il inscrit comme PA agréée sur le registre DGFiP ? (2) couvre-t-il vos besoins comptables actuels (facturation seule, ou compta complète) ? (3) le tarif inclut-il l'envoi électronique natif, ou faudra-t-il payer un module supplémentaire après septembre 2026 ?
Quelle solution selon votre profil
- Micro-entrepreneur non assujetti à la TVA : Tiime ou Abby en gratuit, conformes e-invoicing, aucun engagement.
- Professionnel libéral (BNC) : Indy, spécialement optimisé pour ce public, PA agréée.
- TPE/PME avec expert-comptable : Pennylane, pour la collaboration en temps réel et les intégrations comptables.
- PME avec force de vente : Sellsy, seule solution qui associe CRM et facturation dans un flux homogène.
- Artisan ou très petite structure : QuickBooks ou Abby, prise en main rapide, tarifs accessibles.
Dans tous les cas, intégrez dès maintenant le critère d'accréditation PA dans votre décision : changer d'outil en urgence à l'automne 2026 sera plus coûteux que d'y penser aujourd'hui.
Sources : DGFiP (registre des plateformes agréées), entreprendre.service-public.fr, pennylane.com, indy.fr, tiime.fr, abby.fr, comparateur-efacturation.fr
